En un coup d'œil
- Missions: Modéliser des processus biologiques et analyser des données génomiques pour comprendre les écosystèmes marins.
- Entreprise: Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes, équipe ComBi innovante et interdisciplinaire.
- Avantages: Opportunités de recherche passionnantes et collaboration avec des experts dans le domaine.
- Autres infos: Poste dynamique avec des possibilités de publication et de développement professionnel.
- Pourquoi ce job: Contribuez à la lutte contre le changement climatique en étudiant les cyanobactéries et leur impact sur l'océan.
- Qualifications: Diplôme Bac + 5 en ingénierie avec compétences en biologie numérique et environnement marin.
Le salaire estimé est compris entre 41850 - 51150 € par an.
Léquipe Com Bi fait partie du Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes (LS2N, UMR CNRS 6004), unité de recherche commune à Nantes Université, l'École Centrale de Nantes, IMT Atlantique, le CNRS et Inria.
Elle est dirigée par Damien Eveillard.
Com Bi développe des méthodes informatiques et mathématiques (algorithmique, combinatoire, théorie des graphes, optimisation combinatoire, probabilités) au service de la biologie et de la génomique, en particulier :
- De la comparaison de génomes aux graphes : modélisation des objets biologiques (ADN, ARN, protéines) sous forme de séquences ou de graphes ; analyse comparative de génomes (calcul de distances, recherche de variants structuraux) ; méthodes adaptées aux données de séquençage à haut débit (génomes non assemblés, RNA-seq, données single-cell/DGE-seq).
- De la modélisation des processus biologiques à la modélisation des communautés microbiennes : métédés mathématiques et informatiques du métabolisme et de sa régulération, de l'échelle de la cellule aux interactions entre micro-organismes au sein de microbiomes.
- Extraction de biomarqueurs : outils d'aide à la décision permettant d'identifier des biomarqueurs pertinents à partir des métédés multi-échelles étudiés par l'équipe.
- Développements bioinformatiques : conception d'outils et d'applications pour les biologistes, notamment via la plateforme de bioinformatique Bi RD, partagée avec l'Institut du Thorax.
L'équipe s'inscrit également dans des projets à fort ancrage territorial et interdisciplinaire, comme le programme Tara Océan, illustrant l'usage de l'informatique pour l'étude des écosystèmes marins et des enjeux climatiques.
Le poste permet d’accompagner l'implication de l'équipe Com Bi dans le projet ANR TAXCY.
Missions à Au sein de l'équipe Com Bi du LS2N (Nantes Université), qui développe des méthodes combinatoires et bioinformatiques pour l'étude du vivant, notamment dans le cadre de projets liés l'étude des écosystèmes marins (programme Tara Océan), l'ingénieurée reconstruit et valide des métédés métaboliques à l'échelle du génome pour des cyanobactéries afin de modéliser leur métabolisme et leurs interactions avec l'environnement.
Ce poste vise à doter l'équipe d'outils de modélisation robustes pour mégler comprendre le rôle fonctionnel des cyanobactéries dans les écosystèmes marins et contribuer aux enjeux scientifiques liés à l'océan et au changement climatique.
Activités principales L'ingénieurée reconstruit des métédés métaboliques à l'échelle du génome (GEMs) pour différentes espécies de cyanobactéries.
- Il/elle collectera et annotera les données génomiques disponibles, identifiera les réactions métaboliques et les gènes associés à partir des bases de données de référence (KEGG, Meta Cyc, Uni Prot), puis construirè il les réseaux métaboliques correspondants à l'aide d'outils dédiés (ex. : RAVEN, Carve Me, COBRApy).
- Il/elle vérifiera et corrigera la cohérence stoéchiométrique et thermodynamique des métédés, comblera les lacunes (gap-filling) du réseau métabolique, et validera les métédés par comparaison aux données expérimentales (croissance, flux métaboliques, phénotypes) disponibles pour les souches étudiées.
- Il/elle intégrera ces métédés dans des analyses de flux (FBA, FVA) afin de simuler le comportement métabolique des cyanobactéries dans différentes conditions environnementales, et contribuerá à l'interprétation biologique des résultats en lien avec les biologistes du projet.
- Il/elle présentera les résultats scientifiques à une communauté experte.
- Enfin, il/elle documentera les métédés produits, participerà à leur diffusion (dépôt dans des bases publiques, publications) et assurerá une veille méthodologique sur les outiils de reconstruit et d'analyse de réseaux métaboliques.
Retrouver l'offre complète ici
https://www. univ-nantes. fr/universite/recrutement/nantes-universite-recrute-un-e-ingenieur-e-en-modelisation-de-processus-biologique-ls2n
Formation et/ou qualification : Bac + 5 ingénieur. e généraliste avec une compétence en biologique numérique et environnement marin.
#J-18808-Ljbffr
Ingénieur.e en modélisation de processus biologique in Nantes employeur : Université de Nantes
L'Université de Nantes est un employeur exceptionnel qui valorise le développement personnel et professionnel de ses employés. En tant que directeur de la vie étudiante, vous bénéficierez d'un environnement collaboratif et dynamique, propice à l'innovation et à l'engagement communautaire. Avec des opportunités de croissance continue et un fort accent sur le bien-être des étudiants, travailler ici signifie faire une réelle différence dans la vie des jeunes adultes tout en évoluant dans un cadre stimulant à Nantes.
Conseils d'expert StudySmarter🤫
Voici comment nous pensons que tu pourrais décrocher Ingénieur.e en modélisation de processus biologique in Nantes
✨Immerge-toi dans la communauté !
Les événements locaux comme les conférences en biologie ou les symposiums sont de super occasions pour networker. Si tu peux, participe à des ateliers ou des relevés de terrain en biologie pour rencontrer d'autres passionnés et professionnels du domaine.
✨Utilise les ressources universitaires !
Si tu es encore étudiant ou récent diplômé, n'hésite pas à utiliser les services de carrière de ton université. Beaucoup de facs ont des partenariats avec des entreprises en biologie, ce qui peut te donner un accès privilégié aux offres d'emploi. Reste attentif aux annonces de stages ou premiers emplois dans ta fac.
✨Fais parler de toi dans la recherche !
Publie tes travaux de recherche ou tes projets en biologie sur des plateformes comme ResearchGate ou dans des revues spécialisées. Ça peut non seulement renforcer ton CV, mais aussi te donner de la visibilité auprès de recruteurs à la recherche de talents dans le domaine.
✨Postule directement chez Université de Nantes !
Ne perds pas de temps à tourner autour du pot. Si tu es intéressé par un poste plein temps, rends-toi sur le site de Université de Nantes et postule directement. Montre-leur pourquoi tu es le candidat idéal et ce que tu peux apporter à leur équipe en biologie.
Nous pensons qu'il te faut ces compétences pour exceller en tant que Ingénieur.e en modélisation de processus biologique in Nantes
Quelques conseils pour ta candidature 🫡
Mets en avant ton parcours académique:Dans le domaine de la biologie, il est super important de souligner tes études et les projets que tu as réalisés. Mentionne tes diplômes, comme ta licence ou ton master, ainsi que des travaux pratiques pertinents ou des stages qui montrent ton expérience sur le terrain.
Soigne bien ton CV avec des compétences spécifiques:Assure-toi d'inclure des compétences spécifiques à la biologie, comme la maîtrise des techniques de laboratoire, l'analyse de données, ou des logiciels spécialisés comme R ou Python si tu les utilises. Ça pourra vraiment faire la différence et montrer que tu es opérationnel dès le départ.
Raconte ton côté curieux dans la lettre de motivation:Quand tu rédiges ta lettre de motivation, fais ressortir ta passion pour la biologie. Explique pourquoi tu as choisi ce domaine et comment tu es prêt à apprendre et à grandir avec Université de Nantes. Ça montre que tu es motivé et que tu es prêt à plonger dans l'inconnu!
Prends soin de la présentation globale:Pour un poste à temps plein, il est essentiel que ta candidature soit bien structurée et agréable à lire. Utilise des sections claires, une police lisible et n’hésite pas à utiliser des listes à puces pour mettre en avant tes expériences. Et souviens-toi, postule directement sur notre site pour une chance supplémentaire!
Comment te préparer à un entretien d'embauche chez Université de Nantes
✨Maîtrise des outils de laboratoire
Pour un poste en biologie, il est super important de montrer que tu es à l'aise avec les outils et techniques de laboratoire. Prépare des exemples concrets où tu as utilisé des équipements spécifiques, comme des pipettes ou des microscopes, et n'hésite pas à parler des protocoles que tu as réalisés. Ça montre non seulement ta compétence, mais aussi ton engagement vis-à-vis du travail de laboratoire.
✨Mets en avant tes projets de recherche
Si tu as participé à des projets de recherche, qu'ils soient universitaires ou non, parle-en clairement durant l’entretien ! Prépare un petit portfolio avec des résumés de ces projets, y compris les objectifs, les méthodes et les résultats. Cela peut vraiment faire la différence et montrer ta capacité à mener des recherches tout en travaillant en équipe.
✨Connaissance des questions éthiques
Dans le domaine de la biologie, il y a souvent des enjeux éthiques à considérer. Prépare-toi à discuter de ces sujets, car les intervieweurs cherchent généralement à savoir comment tu abordes les questions morales et éthiques liées à la biologie. Sois prêt à partager ton point de vue sur des exemples contemporains, cela peut vraiment impressionner et montrer ta réflexion critique.
✨Prépare-toi à des études de cas
Pour un emploi à temps plein, il se pourrait que l'on te demande de résoudre des études de cas ou des scénarios spécifiques. Entraîne-toi à analyser des données biologiques ou à proposer des solutions à des problèmes expérimentaux. L'idée est de démontrer ta capacité d'analyse et de résolution de problèmes, ce qui est crucial dans ce domaine !
