OMICs expert

Spore.Bio est une startup deeptech fondée en 2023 qui redéfinit le contrôle de la qualité microbiologique dans la fabrication pharmaceutique, alimentaire et cosmétique. Nous construisons une équipe interdisciplinaire à fort impact à l'intersection de la biophotonique, de l'apprentissage automatique et de la microbiologie, avec une mission commune : développer une technologie révolutionnaire combinant biophotonique et intelligence artificielle pour révolutionner le diagnostic des infections résistantes aux antibiotiques.

Ce projet vise à créer une approche novatrice capable d'identifier rapidement les mécanismes de résistance, de persistance et de tolérance grâce à l'intégration de données optiques, biologiques et computationnelles. Nous recherchons quelqu'un prêt à prendre de réelles responsabilités, à façonner notre manière de travailler et à grandir aux côtés du département qu'il aide à construire.

Responsabilités principales :

• Caractérisation multi-omique de la résistance : Vous travaillerez sur la génomique, la transcriptomique et au moins une des protéomiques ou métabolomiques pour construire une image mécaniste de la résistance, de la persistance et de la tolérance dans notre bibliothèque de souches et isolats cliniques.
• Lien génotype-phénotype : Vous travaillerez avec des données génomiques et de susceptibilité quantitative appariées (AST, MIC) pour caractériser où la prédiction basée sur la séquence est fiable et où elle diverge du phénotype mesuré.
• Curatelle des données pour pipelines prêts à l'emploi : Vous interrogez, curez et structurez des données biologiques complexes et hétérogènes afin qu'elles soient utilisables pour les pipelines d'entraînement sans perdre de rigueur scientifique.
• Travail en tant que pair de l'équipe d'apprentissage profond : Vous contribuerez directement à la conception des modèles et à leur cadrage biologique, pas seulement à la préparation des données.
• Contribution scientifique : Vous contribuerez à des publications, conférences et à la propriété intellectuelle découlant de ce travail.

À propos de vous :

• Un doctorat en génomique microbienne, microbiologie computationnelle, bioinformatique ou discipline étroitement liée est requis.
• Plus de 10 ans d'expérience directe avec la génomique, la transcriptomique et au moins une des protéomiques ou métabolomiques dans un contexte microbien.
• Compréhension mécaniste de la microbiologie, y compris la structure des populations bactériennes et la dynamique évolutive.
• Expérience avec des ensembles de données cliniques hétérogènes, y compris des séquences sous-représentées et des signaux ambigus.
• Proficience avec des approches sans alignement et sans référence.
• Capacité à travailler en collaboration avec des équipes computationnelles.
• Expression claire à l'écrit et à l'oral en anglais.

Pourquoi nous rejoindre ?

• Faites partie d'une équipe interdisciplinaire développant une technologie de diagnostic disruptive.
• Travaillez à la pointe de l'omics microbienne, de la biologie AMR et de l'IA appliquée.
• Possibilité de croissance dans un poste permanent à Paris.

Ce que nous offrons :

• Flexibilité de travail à distance.
• Budget pour équipement de travail à distance.
• Abonnement Gymlib.
• Assurance santé premium.
• Carte Swile pour vos repas.
• Événements d'équipe fréquents.

Processus de recrutement :

• Appel de 30 minutes avec le responsable du recrutement.
• Entretien de personnalité de 45 minutes avec deux membres de l'équipe.
• Étude de cas technique d'une heure suivie d'un débriefing.
• Entretien d'une heure avec les fondateurs.

C'est une opportunité unique pour quelqu'un qui s'épanouit dans la curiosité et a une passion authentique pour la technologie. Rejoignez notre équipe innovante et dynamique, et faisons la différence ensemble !