Senior Software Engineer - Instrument in Paris

Nous recherchons un ingénieur logiciel senior pratique pour travailler sur l'architecture, le développement, l'intégration, les tests et la livraison de la plateforme d'exploitation des instruments de Rivercell - le logiciel qui contrôle le matériel, exécute des protocoles biologiques, surveille les performances des dispositifs, gère les pannes et garantit l'acquisition traçable des données expérimentales.

La plateforme intégrera et orchestrera des sources d'alimentation et de lumière, des microscopes, des caméras, des systèmes de contrôle de température, des capteurs, des systèmes de motifs projetés et d'autres équipements de laboratoire. Elle automatisera des protocoles complexes de biologie cellulaire, fournira des interfaces d'ingénierie et d'opérateur, et gérera l'acquisition de données à haut débit, le stockage tampon, les métadonnées et le transfert vers des systèmes de traitement et de stockage en aval.

Vous serez confronté à plusieurs défis d'ingénierie, notamment :

• Des milliers de gouttelettes contenant des centaines de milliers de cellules humaines seront déplacées simultanément à travers une excitation lumineuse et électrique projetée.
• Elles seront détectées et suivies par vision par ordinateur, acheminées sans se toucher, imagées selon un calendrier et comptabilisées depuis leur création jusqu'à leur sortie de l'instrument.
• Entre les opérations microfluidiques, la plateforme évaluera l'état du dispositif, détectera des écarts tels que des trajectoires de gouttelettes anormales, des changements de volume, des excursions de température, des dérives d'impédance ou des défauts d'imagerie, tentera une récupération automatique et élèvera les problèmes non résolus à un opérateur.
• La détection et l'imagerie des instruments peuvent générer plusieurs téraoctets de données brutes par heure, nécessitant une acquisition fiable et une traçabilité expérimentale complète.

Vous travaillerez main dans la main avec une équipe interdisciplinaire couvrant la microfluidique, l'ingénierie génétique, l'IA, la vision par ordinateur, l'automatisation de bio-laboratoire, l'optique, l'électronique, l'ingénierie mécanique et la biologie. Vous serez une partie intégrante d'un projet de startup ambitieux et passionnant dès son inception.

Responsabilités :

• Aider à définir l'architecture logicielle globale de l'instrument, y compris l'abstraction matérielle, les services de dispositifs, l'orchestration, l'exécution des protocoles, la détection, le contrôle de qualité, l'observabilité, les tests et les applications pour opérateurs.
• Écrire et examiner le code de production, posséder des composants partagés critiques et établir la norme pour la qualité de développement, la simplicité, la documentation et la vélocité.
• Concevoir des couches d'abstraction matérielle stables et des interfaces versionnées.
• Concevoir les machines d'état, le moteur de flux de travail, les systèmes de planification et le modèle de configuration nécessaires à l'exécution de protocoles biologiques de longue durée.
• Synchroniser les motifs projetés, l'excitation électrique, l'acquisition d'images, le mouvement, la détection et les événements de protocole avec les garanties de timing requises par l'instrument.
• Définir des stratégies de détection de pannes, de réessai, de récupération, d'état sûr et d'escalade pour les pannes matérielles, logicielles et de processus biologiques.
• Assurer une observabilité et une traçabilité complètes de l'état du dispositif, des commandes, des mesures des capteurs, des étapes de protocole, des échantillons, des gouttelettes, des données générées et des configurations logicielles.
• Concevoir et livrer des outils d'ingénierie et des interfaces pour opérateurs pour le développement matériel, la configuration des protocoles, la surveillance en direct, le diagnostic, le contrôle de qualité et les tests de production.
• Établir des environnements de simulation, de logiciel dans la boucle et de matériel dans la boucle permettant de tester les protocoles, le comportement des dispositifs et les modes de défaillance sans accès continu à l'instrument physique complet.
• Construire des pipelines d'acquisition à haut débit fiables pour les images et les données des capteurs, y compris le stockage tampon, l'intégrité des métadonnées, la gestion de la pression arrière et le transfert vers des systèmes de stockage et de traitement en aval.
• Définir des interfaces avec des systèmes de vision par ordinateur, de données scientifiques, d'IA et d'informations de laboratoire, en travaillant avec des spécialistes dédiés sur les algorithmes sous-jacents et les produits de données.
• Posséder la stratégie de construction, de publication, de déploiement, de mise à jour, de diagnostic et de retour en arrière pour les logiciels fonctionnant sur des instruments de développement et de production.
• Diriger des analyses de causes profondes transversales où les logiciels, l'optique, l'électronique, la microfluidique, le matériel, la biologie ou les systèmes de données interagissent.

Opportunité de travailler sur un projet de pointe dans le domaine de la biotechnologie.

Opportunité de rejoindre une équipe ambitieuse et une startup impactante parmi les premiers employés.

Salaire compétitif et package d'équité.

Opportunités passionnantes de croissance personnelle et professionnelle au sein de l'équipe.

Vous avez plus de 5 ans d'expérience pertinente en ingénierie logicielle, y compris la responsabilité de l'architecture et de la livraison de systèmes de production complexes. Vous avez un historique de construction de logiciels qui contrôlent des équipements physiques, tels que des instruments scientifiques, de la robotique, des dispositifs médicaux, des outils semi-conducteurs, de l'automatisation industrielle ou des systèmes de laboratoire. Vous maîtrisez profondément Python, y compris la concurrence, l'isolation des processus, le profilage des performances, le typage, l'emballage, les tests et le jugement de ne pas être trop astucieux lorsque la fiabilité est importante. Vous combinez un fort jugement architectural avec une volonté de déboguer les interfaces matérielles, d'inspecter les journaux, d'écrire des bancs d'essai et de résoudre des problèmes pratiques au banc. Lorsque vous êtes confronté à un grand système, vous identifiez instinctivement la plus petite architecture de bout en bout qui peut produire une version fonctionnelle utile en quelques semaines, en utilisant efficacement la simulation, les composants réutilisables et le développement assisté par IA. Vous êtes à l'aise avec l'ambiguïté dans un environnement scientifique : les spécifications évolueront à mesure que la biologie et le matériel nous enseignent, et vous savez comment concevoir des systèmes qui peuvent évoluer sans devenir chaotiques. Vous êtes autonome, engagé, enthousiaste et à l'aise pour travailler avec un état d'esprit créatif et stimulant. Vous êtes rigoureux dans la conception des systèmes, les tests, la documentation, l'interprétation des données, l'analyse des incidents et la communication de l'incertitude. Vous avez d'excellentes compétences en communication et parlez couramment l'anglais ; une maîtrise professionnelle du français est utile mais pas requise.

Vous avez une expérience ou des connaissances antérieures dans un ou plusieurs des domaines suivants :

• Architectures orientées événements, distribuées ou basées sur des services pour des systèmes physiques.
• Moteurs de flux de travail, machines d'état, orchestration complexe, planification ou systèmes de contrôle distribués.
• Systèmes de contrôle en temps réel, quasi temps réel, déterministes ou pertinents pour la sécurité.
• Communication des dispositifs via des protocoles série, USB, Ethernet, SCPI ou similaires.
• Déploiement basé sur Linux, conteneurs, observabilité, mise en réseau, diagnostics à distance et mises à jour logicielles automatisées.
• Vision par ordinateur ou analyse d'images à grande échelle, en particulier pour la microscopie, le suivi ou le contrôle en boucle fermée.
• Acquisition et transfert d'images, de vidéos ou de données de capteurs à haut débit.
• Environnements de simulation, jumeaux numériques, tests en boucle logicielle ou matérielle.
• Interfaces pour opérateurs et applications d'ingénierie pour des instruments complexes.