En un coup d'œil
- Missions: Participez à des projets scientifiques en bio-informatique et gérez des données NGS.
- Entreprise: Université PSL, un leader mondial de l'enseignement supérieur et de la recherche.
- Avantages: Environnement dynamique, opportunités de carrière et engagement pour la diversité.
- Autres infos: Travaillez avec une équipe passionnée au Muséum National d’Histoire Naturelle à Paris.
- Pourquoi ce job: Contribuez à des recherches innovantes et impactez le domaine de la bio-informatique.
- Qualifications: Master 2 en bio-informatique ou domaines connexes, compétences en analyse de données.
Le salaire estimé est compris entre 47475 - 58025 € par an.
Ingénieur / ingénieure d’études en Bio-informatique (F/H)
Notre établissement fait partie de l'Université PSL.
Située au cœur de Paris, celle-ci fait dialoguer tous les domaines du savoir, de l'innovation et de la création.
Classée parmi les 50 premières universités mondiales, elle forme au plus près de la recherche des chercheurs, artistes, ingénieurs, entrepreneurs ou dirigeants conscients de leur responsabilité sociale, individuelle et collective.
Structure d'accueil
L’École Pratique des Hautes Études (EPHE) est un grand établissement d’enseignement supérieur et de recherche, établissement-composante de l’Université Paris Sciences et Lettres (PSL), et membre fondateur du Campus Condorcet.
L’EPHE-PSL est implantée sur plusieurs sites en France métropolitaine et en Polynésie française.
La candidate ou le candidat retenu travaillera au sein de l'équipe DIVA (« Diversification et adaptation aux échelles micro et macro-évolutives ») de l’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB, UMR 7205) située au Muséum National d’Histoire Naturelle à Paris.
L’équipe DIVA est composée de 11 enseignants-chercheurs permanents, deux techniciennes, un ingénieur de recherche, et plusieurs doctorants / doctorantes et stagiaires.
L’équipe mène des recherches portant sur les processus évolutifs à travers diverses disciplines comme la génétique des populations, l’écologie comportementale, la génétique quantitative, l’écologie évolutive, en partenariat avec plusieurs équipes en France et à l’étranger.
Activités principales
La personne recrutée participera aux projets scientifiques des différentes membres de l’équipe DIVA et sera sous la responsabilité du correspondant EPHE de l’unité, actuellement Stefano Mona.
La candidate ou le candidat retenu sera responsable de la gestion et du traitement bio-informatique des données, notamment du type «Next Generation Sequencing» (NGS), issues de plusieurs projets de l’équipe et ponctuellement venir en appui aux projets des autres équipes de l'UMR.
Elle ou il devra utiliser et développer des pipelines bio-informatiques pour le traitement des librairies produites par des méthodes de type Whole Genome Sequencing (Illumina sort-reads), long read sequencing (Pac Bio et ONT), Hi-C sequencing, ou transcriptomique (long et short reads).
Outre le traitement bio-informatique, elle ou il devra également analyser les données produites et présenter et interpréter les résultats dans leur contexte scientifique.
Ces investissements se traduiront notamment par la co-signature des articles scientifiques de l’équipe.
En termes de gestion des données, la personne recrutée devra coordonner la sauvegarde des données «omics» sur les serveurs de l’EPHE-PSL en accord avec la direction des systèmes d’information de l’EPHE-PSL.
- Profil du candidat
- Savoirs et compétences attendus
- Savoirs
- Maîtrise de l’analyses de données «omics»,
- Connaissances au moins superficielles des différences techniques de séquençage NGS, et surtout des données produites par ces méthodes,
- Connaissance du système d’exploitation GNU/Linux ou autre Unix-like,
- Connaissance d’au moins un langage de programmation utilisé en analyse de données (R, Python, Perl, Julia, …).
- Connaissance de la syntaxe d’un shell en ligne de commande (notamment bash, zsh ou fish, et les programmes GNU comme sed ou awk)
- Connaissance de plusieurs logiciels dédiés à l’analyses des données NGS: BWA, SAMtools, GATK, PICARD, ANGSD, Hifiasm….
- Facultatif: connaissance de logiciels pour l’analyse des données précédemment filtrés(fastsimcoal, Beast, LEA, ADMIXTURE entre autres)
- Connaissance des bonnes pratiques du cycle de la donnée et des principes FAIR.
- Anglais, lu et écrit.
- Savoirs-faire
- Utiliser des pipelines déjà existant en ligne de commande et les modifier si nécessaire pour le traitement de données de type NGS dans le cadre des projets menés par l’équipe.
- Traiter des gros jeux de données en travaillant sur un cluster informatique.
- Organiser le traitement des jeux de données selon les bonnes pratiques au sein d’une équipe de recherche.
- Interpréter les résultats des analyses dans leur contexte scientifique.
- Rédiger en anglais les parties des articles scientifiques en lien avec les données analysées.
- Facultatif: analyser statistiquement les données obtenues à l’aide d’un langage de programmation (R, Python, Julia…) et/ou à partir de programmes existants pour des analyses plus spécialisées de génétique des populations ou phylogénie.
- Savoirs-être
- Excellente capacité relationnelle. La candidate ou le candidat retenu sera amené à travailler en groupe et à communiquer ses avancements sur une base régulière.
- Esprit d’initiative et autonomie.
- Rigueur et sens de l’organisation.
- FORMATIONS ET EXPÉRIENCE PROFESSIONNELLE SOUHAITABLES
- Niveau master 2 ou équivalent pour les mentions suivantes: Bio-Informatique, Mathématique appliquée et statistiques, Sciences du vivant, Biodiversité Écologie et Évolution.
Des expériences antérieures dans un laboratoire de recherche sur des projets d’analyse de données, spécifiquement de bio-informatique, seront considérées favorables.
- Fonctionnaire de catégorie A ou CDD d’un an, renouvelable
- Non discrimination, ouverture et transparence
Notre établissement, comme l'ensemble de l'Université PSL, s’engage à soutenir et promouvoir l’égalité, la diversité et l’inclusion au sein de ses communautés.
Nous encourageons les candidatures issues de profils variés, que nous veillerons à sélectionner via un processus de recrutement ouvert et transparent.
- Ils permettent la visualisation des vidéos sur notre site. (Youtube)
- #J-18808-Ljbffr
Ingénieur / ingénieure d’études en Bio-informatique in Paris employeur : PSL Université Paris
Rejoindre notre institution d'enseignement supérieur à Paris, c'est intégrer un environnement dynamique et stimulant où l'innovation pédagogique est au cœur de nos valeurs. Nous offrons des opportunités de développement professionnel continu, un cadre de travail collaboratif et une culture axée sur l'excellence académique. En tant que Chef de Projet, vous aurez la chance de contribuer à des formations de pointe en sciences et intelligence artificielle, tout en bénéficiant d'un réseau prestigieux et d'une expérience enrichissante dans le secteur éducatif.
Conseils d'expert StudySmarter🤫
Voici comment nous pensons que tu pourrais décrocher Ingénieur / ingénieure d’études en Bio-informatique in Paris
✨Rejoignez des communautés scientifiques !
Chercher un job en biologie, c'est comme faire partie d'un grand laboratoire collectif. Participez à des forums en ligne comme ResearchGate ou Biospace où les biologistes partagent des opportunités. Rencontrer d'autres professionnels peut vraiment ouvrir des portes et te tenir au courant des dernières tendances.
✨Assiste à des conférences et des symposiums !
Les événements comme les symposiums scientifiques ou les conférences de biologie sont des super occasions pour rencontrer des recruteurs et échanger sur tes passions. Prépare-toi à te présenter : un petit pitch bien rodé peut faire toute la différence !
✨Utilise les réseaux locaux !
N'hésite pas à explorer les laboratoires ou les instituts de recherche près de chez toi. Envoie des emails ou passe les voir en personne. Cette approche montre ta motivation et pourra te donner un vrai avantage par rapport à d’autres candidats.
✨Postule directement chez PSL Université Paris !
Quand tu vois une offre pour un poste de biologiste chez PSL Université Paris, ne perds pas de temps ! Postule via notre site et assure-toi de personnaliser ta candidature. Mentionne pourquoi tu veux rejoindre PSL Université Paris en particulier, ça fait toujours la différence !
Nous pensons qu'il te faut ces compétences pour exceller en tant que Ingénieur / ingénieure d’études en Bio-informatique in Paris
Quelques conseils pour ta candidature 🫡
Fais ressortir tes compétences spécifiques en biologie:Envoie-nous un CV qui fait briller tes compétences en biologie, comme tes connaissances en biochimie, génétique ou biologie moléculaire. N'oublie pas d'inclure tes expériences de laboratoire, tes projets de recherche ou tes stages qui montrent ta maîtrise des techniques scientifiques pertinentes.
Utilise un format clair et structuré:Pour un rôle en biologie chez PSL Université Paris, un CV bien structuré est clé. Ajoute une section sur tes publications, présentations ou participations à des conférences si tu en as. Pense aussi à préciser les logiciels ou instruments que tu maîtrises, cela pourrait nous intéresser !
Raconte-nous ta passion pour la biologie:Dans ta lettre de motivation, fais-nous part de ton enthousiasme pour la biologie et ton envie de contribuer aux missions de PSL Université Paris. Explique ce qui t'a amené à choisir ce domaine et comment tu vois ton avenir dans la biologie, cela peut vraiment faire la différence.
Sois précis sur tes expériences professionelles:Quand tu écris ton CV, utilise des exemples concrets de tes précédents postes en biologie, en détaillant tes responsabilités et résultats. Si tu as travaillé sur des projets spécifiques, n'hésite pas à les mentionner, ça nous donnera une bonne idée de ce que tu peux apporter à PSL Université Paris.
Comment te préparer à un entretien d'embauche chez PSL Université Paris
✨Connaissance des techniques de laboratoire
Pour un poste en biologie, il est crucial de bien comprendre les techniques de laboratoire que vous allez utiliser. Préparez-vous à discuter de votre expérience avec des outils comme le PCR, la chromatographie ou la microscopie. Peut-être même qu'on vous posera des questions techniques ou des scénarios de laboratoire spécifiques.
✨Préparez votre portfolio de projets
Même si c'est un emploi à temps plein, montrer votre capacité à appliquer vos connaissances dans des projets pratiques peut vous donner un avantage. Ayez sous la main des exemples de recherches ou de stages précédents où vous avez mis en œuvre vos compétences. Votre portfolio pourrait être le facteur décisif lors de l'entretien !
✨Passion pour la biologie
Lors de votre entretien, n’hésitez pas à partager ce qui vous passionne dans le domaine de la biologie. Des projets récents, des découvertes marquantes ou même des livres qui vous ont inspiré peuvent montrer votre engagement et votre curiosité. Cela pourrait séduire l'équipe de PSL Université Paris et montrer que vous êtes prêt à vous investir.
✨Préparez-vous à des questions théoriques
Dans le domaine de la biologie, les questions théoriques sur des concepts clés sont fréquentes dans les entretiens. Révisez les bases et comprenez bien les sujets récents de recherche. La capacité à articuler des idées complexes dans un langage accessible peut également impressionner vos interlocuteurs.
