Research Engineer Position in Computational Genomics and Scientific Software in Paris

Research Engineer Position in Computational Genomics and Scientific Software in Paris

Paris Full Time 61650 - 75350 € / an (estimé) Sur site
I

En un coup d'œil

  • Missions: Contribuer au développement de logiciels et méthodes en bioinformatique pour des projets de recherche innovants.
  • Entreprise: Institut Pasteur, un leader en recherche scientifique avec une culture collaborative.
  • Avantages: Salaire compétitif, environnement dynamique, et opportunités de développement professionnel.
  • Autres infos: Possibilités de croissance de carrière dans un environnement stimulant.
  • Pourquoi ce job: Rejoignez une équipe passionnée et impactez la recherche en génomique computationnelle.
  • Qualifications: Diplôme de Master en bioinformatique ou domaine connexe, expérience en recherche souhaitée.

Le salaire estimé est compris entre 61650 - 75350 € par an.

Institut Pasteur, Paris, France

Le Hub de Bioinformatique et Biostatistique à l'Institut Pasteur recrute un ingénieur de recherche senior en bioinformatique. L'ingénieur consacrera 80 % de son temps à travailler dans l'équipe « bioinformatique des séquences » dirigée par le Dr Rayan Chikhi. Les 20 % restants seront consacrés à des contributions techniques, des formations ou des activités d'enseignement au Hub de Bioinformatique de l'Institut Pasteur.

Fonctions :

  • Contribuer au développement scientifique, méthodologique et logiciel des projets de recherche en bioinformatique, avec un accent sur la génomique computationnelle, la métagénomique, les méthodes basées sur les k-mers, l'analyse de données anciennes ou dégradées, l'apprentissage automatique et l'échelle des logiciels et des pipelines d'analyse.
  • Développer de nouvelles méthodes, logiciels et pipelines d'analyse, en particulier pour les données de séquençage à grande échelle, les approches basées sur les k-mers et les méthodes d'apprentissage automatique.
  • Documenter, maintenir et diffuser des logiciels scientifiques open-source, des workflows reproductibles ou des outils intégrés dans des environnements partagés tels que Galaxy, lorsque cela est pertinent.
  • Contribuer à la conception, à la mise en œuvre et à la rédaction de projets de recherche collaboratifs ainsi qu'à des demandes de financement.
  • Participer à la rédaction, à la soumission et à la révision de publications scientifiques.
  • Participer aux projets d'analyse bioinformatique soumis au Hub de Bioinformatique et Biostatistique.
  • Partager, conseiller et guider les utilisateurs et collègues sur l'utilisation des méthodes, outils et meilleures pratiques pour l'analyse des données génomiques, métagénomiques et paléogénomiques.

Profil :

Le poste nécessite un profil expérimenté combinant recherche méthodologique en bioinformatique, développement de logiciels scientifiques et analyse de données de séquençage à grande échelle, avec une expérience démontrée en métagénomique, méthodes basées sur les k-mers, analyse de données anciennes ou dégradées, et apprentissage automatique. Les candidats doivent détenir au moins un diplôme de niveau Master (ou équivalent) en bioinformatique, informatique, science des données, biologie computationnelle ou discipline connexe. Une expérience de recherche au niveau doctorat, postdoctorat, ingénierie de recherche avancée ou équivalent est fortement préférée.

Compétences requises :

  • Expertise en bioinformatique : Maîtrise des données de séquençage à haut débit : génomique, métagénomique, paléogénomique, assemblage, cartographie, contrôle de qualité, méthodes basées sur les k-mers.
  • Expérience pratique avec des méthodes d'apprentissage automatique ou d'apprentissage profond appliquées aux données de séquençage.
  • Développement de logiciels et infrastructures : Expérience solide en programmation scientifique (Python et/ou C/C++).
  • Maîtrise des environnements de calcul scientifique : Linux, Bash, Git, HPC, conteneurs, workflows reproductibles.
  • Contribution à des projets scientifiques, publications et demandes de financement ; rédaction scientifique en anglais.
  • Compétences transversales : Autonomie, rigueur, compétences organisationnelles, capacité à mener un projet jusqu'à publication ; excellentes compétences interpersonnelles et travail d'équipe avec une large gamme de profils (biologistes, informaticiens, plateformes...).

Une expérience antérieure dans le développement d'outils pour la métagénomique, l'ADN ancien, de grandes collections de génomes, des méthodes basées sur les k-mers, l'apprentissage profond, les infrastructures cloud/HPC, Galaxy ou des workflows bioinformatiques reproductibles sera considérée comme un avantage significatif.

Date limite : 25 octobre

Research Engineer Position in Computational Genomics and Scientific Software in Paris employeur : INSTITUT PASTEUR

Rejoindre notre institut de recherche biomédicale à Paris, c'est intégrer un environnement multiculturel et stimulant où l'innovation est au cœur de nos activités. Nous offrons des opportunités de croissance professionnelle, des activités culturelles enrichissantes et un remboursement des transports, faisant de nous un employeur de choix pour ceux qui cherchent à contribuer à des projets significatifs en immunologie et biologie.

I

Coordonnées :

Équipe de recrutement de INSTITUT PASTEUR

Conseils d'expert StudySmarter🤫

Voici comment nous pensons que tu pourrais décrocher Research Engineer Position in Computational Genomics and Scientific Software in Paris

✨Rejoignez des communautés scientifiques !

Chercher un job en biologie, c'est comme faire partie d'un grand laboratoire collectif. Participez à des forums en ligne comme ResearchGate ou Biospace où les biologistes partagent des opportunités. Rencontrer d'autres professionnels peut vraiment ouvrir des portes et te tenir au courant des dernières tendances.

✨Assiste à des conférences et des symposiums !

Les événements comme les symposiums scientifiques ou les conférences de biologie sont des super occasions pour rencontrer des recruteurs et échanger sur tes passions. Prépare-toi à te présenter : un petit pitch bien rodé peut faire toute la différence !

✨Utilise les réseaux locaux !

N'hésite pas à explorer les laboratoires ou les instituts de recherche près de chez toi. Envoie des emails ou passe les voir en personne. Cette approche montre ta motivation et pourra te donner un vrai avantage par rapport à d’autres candidats.

✨Postule directement chez INSTITUT PASTEUR !

Quand tu vois une offre pour un poste de biologiste chez INSTITUT PASTEUR, ne perds pas de temps ! Postule via notre site et assure-toi de personnaliser ta candidature. Mentionne pourquoi tu veux rejoindre INSTITUT PASTEUR en particulier, ça fait toujours la différence !

Nous pensons qu'il te faut ces compétences pour exceller en tant que Research Engineer Position in Computational Genomics and Scientific Software in Paris

Bioinformatics expertise
Analyse de données de séquençage à haut débit
Méthodes basées sur les k-mers
Machine learning
Développement de logiciels scientifiques
Programmation en Python et/ou C/C++
Environnements de calcul scientifique (Linux, Bash, Git, HPC)

Quelques conseils pour ta candidature 🫡

Fais ressortir tes compétences spécifiques en biologie:Envoie-nous un CV qui fait briller tes compétences en biologie, comme tes connaissances en biochimie, génétique ou biologie moléculaire. N'oublie pas d'inclure tes expériences de laboratoire, tes projets de recherche ou tes stages qui montrent ta maîtrise des techniques scientifiques pertinentes.

Utilise un format clair et structuré:Pour un rôle en biologie chez INSTITUT PASTEUR, un CV bien structuré est clé. Ajoute une section sur tes publications, présentations ou participations à des conférences si tu en as. Pense aussi à préciser les logiciels ou instruments que tu maîtrises, cela pourrait nous intéresser !

Raconte-nous ta passion pour la biologie:Dans ta lettre de motivation, fais-nous part de ton enthousiasme pour la biologie et ton envie de contribuer aux missions de INSTITUT PASTEUR. Explique ce qui t'a amené à choisir ce domaine et comment tu vois ton avenir dans la biologie, cela peut vraiment faire la différence.

Sois précis sur tes expériences professionelles:Quand tu écris ton CV, utilise des exemples concrets de tes précédents postes en biologie, en détaillant tes responsabilités et résultats. Si tu as travaillé sur des projets spécifiques, n'hésite pas à les mentionner, ça nous donnera une bonne idée de ce que tu peux apporter à INSTITUT PASTEUR.

Comment te préparer à un entretien d'embauche chez INSTITUT PASTEUR

✨Connaissance des techniques de laboratoire

Pour un poste en biologie, il est crucial de bien comprendre les techniques de laboratoire que vous allez utiliser. Préparez-vous à discuter de votre expérience avec des outils comme le PCR, la chromatographie ou la microscopie. Peut-être même qu'on vous posera des questions techniques ou des scénarios de laboratoire spécifiques.

✨Préparez votre portfolio de projets

Même si c'est un emploi à temps plein, montrer votre capacité à appliquer vos connaissances dans des projets pratiques peut vous donner un avantage. Ayez sous la main des exemples de recherches ou de stages précédents où vous avez mis en œuvre vos compétences. Votre portfolio pourrait être le facteur décisif lors de l'entretien !

✨Passion pour la biologie

Lors de votre entretien, n’hésitez pas à partager ce qui vous passionne dans le domaine de la biologie. Des projets récents, des découvertes marquantes ou même des livres qui vous ont inspiré peuvent montrer votre engagement et votre curiosité. Cela pourrait séduire l'équipe de INSTITUT PASTEUR et montrer que vous êtes prêt à vous investir.

✨Préparez-vous à des questions théoriques

Dans le domaine de la biologie, les questions théoriques sur des concepts clés sont fréquentes dans les entretiens. Révisez les bases et comprenez bien les sujets récents de recherche. La capacité à articuler des idées complexes dans un langage accessible peut également impressionner vos interlocuteurs.