Ingénieur-e en génie logiciel in Saint-Genès-Champanelle

Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous rejoindrez l’Unité de Nutrition Humaine, au sein de la Plateforme d’Exploration du Métabolisme (PFEM), qui est une infrastructure scientifique collective INRAE dont l'équipe Métabolisme et Spectrométrie de Masse (MSM) est dédiée à la métabolomique. L'intérêt principal de recherche de la PFEM concerne en particulier le développement de méthodes analytiques basées sur la spectrométrie de masse et d'outils bioinformatiques pour l'étude des relations entre nutrition et santé : profilage métabolique par des approches multiplateformes dans les biofluides et les tissus, développement de stratégies analytiques pour l'identification de biomarqueurs à l'aide d'outils de spectrométrie de masse et bioinformatiques, développement de modèles et d'outils pour améliorer l'extraction de connaissances à partir de données de haut débit. La PFEM est un des membres fondateurs de l'infrastructure d'avenir MetaboHUB (MTH).

Au sein du pôle « Gestion des données et des connaissances » de l’UMS MTH-Core, vous contribuerez à la mise en œuvre, à l’évolution et au maintien en conditions opérationnelles des systèmes d’information de l’infrastructure MetaboHUB, en réponse aux besoins des projets et des utilisateurs.

Votre mission consistera à exploiter et faire évoluer les applications web structurantes de l’infrastructure, en particulier MAMA (portail de gestion des demandes d’analyses) et GRANDMA (outil de production et de validation de rapports). Vous assurerez leur maintenance corrective et évolutive, le support aux utilisateur.trice.s, ainsi que la conception, le développement et la documentation de nouvelles fonctionnalités, en lien étroit avec les équipes projet.

Vous interviendrez sur l’ensemble de la chaîne applicative (front-end, back-end, API, bases de données, intégration aux systèmes d’information), en appliquant les bonnes pratiques de développement logiciel, notamment en matière de tests (unitaires, d’intégration, automatisés) et d’intégration et déploiement continus (CI/CD).

Vous serez plus particulièrement en charge de :

• Participer à l’administration des systèmes d’information supports (environ 10% de l’activité), notamment à travers la gestion des comptes utilisateur.trice.s sur les outils collaboratifs et de développement (Nextcloud, forge logicielle INRAE) ;
• Contribuer au suivi du projet AgroDataRing (environ 10%), dédié à l’archivage et à la valorisation des données scientifiques. Dans ce cadre, vous interviendrez en appui aux équipes informatiques des sites distants pour l’administration des nœuds de MetaboHUB, afin de garantir une gestion cohérente, harmonisée et pérenne des données à l’échelle du consortium.

Conditions particulières d’activité : Points de réunion en visioconférence régulier.

Formations et compétences recherchées

Licence (Bac+3) Formation recommandée : Diplôme de master 2 en bioinformatique / informatique.

Connaissances souhaitées :

• Maîtrise des technologies et outils de développement web, notamment TypeScript, Webpack, React.js et Express.
• Bonne connaissance des pratiques d’intégration et de déploiement continus (CI/CD), en particulier dans l’environnement GitLab (pipelines, runners).
• Maîtrise de Git et des workflows associés (gestion de branches, merge requests, revues de code, versioning).
• Conception et utilisation d’API REST, avec une bonne maîtrise des standards de documentation tels qu’OpenAPI.
• Mise en œuvre de stratégies de tests (unitaires, d’intégration, automatisés) intégrées aux pipelines CI/CD ; utilisation d’outils d’automatisation tels qu’Ansible.
• Maîtrise des bases de données relationnelles, en particulier PostgreSQL, et du langage SQL.
• Sensibilité aux enjeux de sécurité applicative (authentification, gestion des autorisations, bonnes pratiques OWASP).
• Capacité à produire une documentation technique claire (architecture, API, procédures d’installation et l’exploitation).
• Connaissance des environnements cloud, notamment OpenStack.
• La maîtrise de PHP (Symfony, Doctrine) ainsi que de Bootstrap constitue un atout.

Expérience appréciée :

• Solide expérience en développement web fullstack.
• Expérience en virtualisation et conteneurisation d’applications avec Docker et Docker Compose.
• Pratique des outils de gestion de projets et de documentation (forges logicielles, systèmes de tickets, wikis).

Aptitudes recherchées :

• Excellentes aptitudes relationnelles pour recueillir, analyser et formaliser les besoins des différentes plateformes du consortium.
• Goût pour le travail collaboratif et la coopération interdisciplinaire.
• Autonomie, rigueur et sens de l’organisation.
• Capacité d’analyse et de résolution de problèmes.
• Sens du service et attention portée aux besoins des utilisateurs.
• Intérêt pour l’innovation numérique et les projets à impact sociétal.

Votre qualité de vie à INRAE :

• Jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein) ;
• D'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
• D dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
• D'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
• D'une restauration collective.

Le site de Theix situé à Saint-Genès-Champanelle est desservi par la ligne T2C numéro P39 ainsi qu’une ligne de transport à la demande, il est également équipé de stationnements et de services dédiés à la pratique du vélo.

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. À ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques.