Post-doctorat (H/F) — Épidémiogénétique de la résistance à la coccidiose chez le poulet in Jouy-en-Josas

Post-doctorat (H/F) — Épidémiogénétique de la résistance à la coccidiose chez le poulet in Jouy-en-Josas

Jouy-en-Josas Full Time 49500 - 60500 € / an (estimé) Sur site
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En un coup d'œil

  • Missions: Analyse et modélise des données sur la résistance à la coccidiose chez le poulet.
  • Entreprise: INRAE, leader mondial en recherche agricole et environnementale.
  • Avantages: Jusqu'à 30 jours de congés, soutien parental, formations et activités culturelles.
  • Autres infos: Travail dynamique avec des opportunités de croissance professionnelle.
  • Pourquoi ce job: Contribuez à des recherches innovantes pour améliorer la santé animale et l'agroécologie.
  • Qualifications: Doctorat en génétique animale, épidémiologie ou discipline connexe requis.

Le salaire estimé est compris entre 49500 - 60500 € par an.

Présentation INRAE L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France.

INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal.

Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi‑performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités Vous exercerez votre activité au sein de l'unité mixte de recherche INRAE « Génétique Animale et Biologie Intégrative » (GABI, 130 agents permanents, département GA « Génétique Animale ») sur le site INRAE de Jouy-en-Josas (78), à proximité de Paris.

Au sein de GABI, vous intégrerez l'équipe Ge MS : « Génétique, Microbiote, Santé ».

L'équipe étudie l'impact combiné de la génétique, du microbiote intestinal et de l'immunité, ainsi que leurs interactions, sur la santé des porcs et des poulets.

Elle analyse le déterminisme génétique de la résistance à des agents pathogènes spécifiques et développe des approches de biologie intégrative pour identifier des biomarqueurs prédictifs ou des signatures de bonne santé exploitables en élevage et/ou pour la sélection.

Votre mission s'inscrira dans le partenariat européen EUPAHW (European Partnership on Animal Health and Welfare), au sein de l'activité SOA23 consacrée aux approches épidémiogénétiques de la santé animale.

Améliorer la résistance des élevages aux maladies infectieuses est un levier majeur de la transition agroécologique, du bien‑être animal et de la réduction des intrants.

La coccidiose aviaire, endémique et coûteuse, illustre bien cet enjeu : la résistance croissante des Eimeria aux anticoccidiens et le coût des vaccins rendent nécessaire le recours à des stratégies alternatives, parmi lesquelles la sélection génétique.

Or les modèles de génétique quantitative classiques prédisent mal l'effet de la sélection sur la prévalence d'une maladie infectieuse, car ils ignorent les interactions hôte‑hôte et la dynamique de transmission au sein des groupes.

L'épidémiogénétique combine épidémiologie et génétique pour orienter la sélection vers des caractères favorisant la santé animale face aux maladies infectieuses, non seulement à l'échelle individuelle, mais aussi au sein du groupe.

Le poste s'appuiera sur les données de l'expérimentation EPIDGENCO, déjà conduite, dont le dispositif constitue une ressource rare à l'échelle internationale.

Deux lignées de poulets contrastées — la race Fayoumi, réputée résistante à la coccidiose, et une lignée commerciale de poulet de chair — ont été élevées en petits groupes au sein desquels un seul animal a été inoculé par Eimeria acervulina, permettant de suivre la dissémination naturelle du parasite vers ses congénères naïfs.

Chaque animal a fait l'objet d'un suivi individuel quotidien pendant un mois, associant mesure de l'excrétion d'oocystes et mesure du poids, complété par des données d'ingestion, un score lésionnel et des prélèvements biologiques.

Ce dispositif ouvre la possibilité d'estimer conjointement plusieurs caractères clés de la réponse de l'hôte, jamais quantifiés simultanément dans cette espèce : sensibilité, infectiosité, durée d'infection, tolérance et croissance compensatrice.

Leur estimation et leur comparaison entre races constituent précisément l'objet de ce post‑doctorat, ainsi que l’exploitation de ses résultats pour des études de simulation et modélisation.

Vous Serez Plus Particulièrement En Charge De Valoriser Ce Jeu De Données Et De Le Relier à Un Cadre De Modélisation Épidémiogénétique, Autour De Trois Axes

  • Analyse des données expérimentales — estimer et comparer les paramètres épidémiologiques et de production des deux races à partir des courbes d'excrétion et de croissance, en mobilisant des modèles de dynamique d'infection de type SIR.

Ce travail prolonge et confronte aux données réelles le modèle de simulation développé dans Ithurbide et al. 2026 (doi. org/10.1371/journal. pone.0343712).

  • Modélisation et simulation — mobiliser le contraste phénotypique observé entre races comme borne supérieure de la variabilité génétique mobilisable, afin de définir une gamme de paramètres génétiques plausibles pour les cinq caractères étudiés.

Couplés au modèle épidémiologique, ces paramètres permettront de simuler des épidémies de coccidiose dans un grand nombre de situations et d'élevages virtuels intégrant une variabilité génétique entre animaux.

Ces simulations serviront à identifier le compromis entre l'effort de phénotypage (nature, fréquence et résolution des mesures du statut infectieux) et la précision de l'évaluation génétique, y compris pour des caractères à modulation sociale tels que la sensibilité et l'infectiosité.

  • Valorisation — rédaction d'articles scientifiques, présentation des résultats lors des réunions du consortium EUPAHW et de conférences internationales.
  • Formations et compétences recherchées
  • Doctorat

Formation recommandée : doctorat en génétique animale, épidémiologie, biostatistique, biologie computationnelle ou discipline connexe.

Connaissances souhaitées : Maîtrise de la programmation statistique (p. ex.

R et/ou Python) et de la manipulation de jeux de données complexes, connaissances en modélisation épidémiologique (modèles compartimentaux) et/ou en génétique quantitative.

Expérience appréciée : Une expérience en modélisation des maladies infectieuses et/ou en génétique quantitative sera particulièrement appréciée.

Aptitudes recherchées : rigueur, organisation, aptitude au travail en autonomie.

  • Votre qualité de vie à INRAE
  • En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :
  • jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
  • d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
  • de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
  • d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
  • de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
  • d'activités sportives et culturelles ;
  • d'une restauration collective.
  • #J-18808-Ljbffr

Post-doctorat (H/F) — Épidémiogénétique de la résistance à la coccidiose chez le poulet in Jouy-en-Josas employeur : INRAE

INRAE est un employeur de choix, offrant un environnement de travail stimulant et collaboratif au sein d'un institut de recherche de renommée mondiale. Les employés bénéficient d'opportunités de développement professionnel continu, d'une culture axée sur l'innovation et la responsabilité sociale, ainsi que d'un engagement fort envers la santé et la sécurité au travail. Situé à Estrées-Mons, le centre Hauts-de-France favorise une approche pluridisciplinaire, permettant aux conseillers en prévention de jouer un rôle clé dans les transitions environnementales et sociétales.

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Coordonnées :

Équipe de recrutement de INRAE

Conseils d'expert StudySmarter🤫

Voici comment nous pensons que tu pourrais décrocher Post-doctorat (H/F) — Épidémiogénétique de la résistance à la coccidiose chez le poulet in Jouy-en-Josas

✨Rejoignez des communautés scientifiques !

Chercher un job en biologie, c'est comme faire partie d'un grand laboratoire collectif. Participez à des forums en ligne comme ResearchGate ou Biospace où les biologistes partagent des opportunités. Rencontrer d'autres professionnels peut vraiment ouvrir des portes et te tenir au courant des dernières tendances.

✨Assiste à des conférences et des symposiums !

Les événements comme les symposiums scientifiques ou les conférences de biologie sont des super occasions pour rencontrer des recruteurs et échanger sur tes passions. Prépare-toi à te présenter : un petit pitch bien rodé peut faire toute la différence !

✨Utilise les réseaux locaux !

N'hésite pas à explorer les laboratoires ou les instituts de recherche près de chez toi. Envoie des emails ou passe les voir en personne. Cette approche montre ta motivation et pourra te donner un vrai avantage par rapport à d’autres candidats.

✨Postule directement chez INRAE !

Quand tu vois une offre pour un poste de biologiste chez INRAE, ne perds pas de temps ! Postule via notre site et assure-toi de personnaliser ta candidature. Mentionne pourquoi tu veux rejoindre INRAE en particulier, ça fait toujours la différence !

Nous pensons qu'il te faut ces compétences pour exceller en tant que Post-doctorat (H/F) — Épidémiogénétique de la résistance à la coccidiose chez le poulet in Jouy-en-Josas

Analyse des données expérimentales
Modélisation épidémiologique
Programmation statistique (R, Python)
Manipulation de jeux de données complexes
Génétique animale
Épidémiologie
Biostatistique

Quelques conseils pour ta candidature 🫡

Fais ressortir tes compétences spécifiques en biologie:Envoie-nous un CV qui fait briller tes compétences en biologie, comme tes connaissances en biochimie, génétique ou biologie moléculaire. N'oublie pas d'inclure tes expériences de laboratoire, tes projets de recherche ou tes stages qui montrent ta maîtrise des techniques scientifiques pertinentes.

Utilise un format clair et structuré:Pour un rôle en biologie chez INRAE, un CV bien structuré est clé. Ajoute une section sur tes publications, présentations ou participations à des conférences si tu en as. Pense aussi à préciser les logiciels ou instruments que tu maîtrises, cela pourrait nous intéresser !

Raconte-nous ta passion pour la biologie:Dans ta lettre de motivation, fais-nous part de ton enthousiasme pour la biologie et ton envie de contribuer aux missions de INRAE. Explique ce qui t'a amené à choisir ce domaine et comment tu vois ton avenir dans la biologie, cela peut vraiment faire la différence.

Sois précis sur tes expériences professionelles:Quand tu écris ton CV, utilise des exemples concrets de tes précédents postes en biologie, en détaillant tes responsabilités et résultats. Si tu as travaillé sur des projets spécifiques, n'hésite pas à les mentionner, ça nous donnera une bonne idée de ce que tu peux apporter à INRAE.

Comment te préparer à un entretien d'embauche chez INRAE

✨Connaissance des techniques de laboratoire

Pour un poste en biologie, il est crucial de bien comprendre les techniques de laboratoire que vous allez utiliser. Préparez-vous à discuter de votre expérience avec des outils comme le PCR, la chromatographie ou la microscopie. Peut-être même qu'on vous posera des questions techniques ou des scénarios de laboratoire spécifiques.

✨Préparez votre portfolio de projets

Même si c'est un emploi à temps plein, montrer votre capacité à appliquer vos connaissances dans des projets pratiques peut vous donner un avantage. Ayez sous la main des exemples de recherches ou de stages précédents où vous avez mis en œuvre vos compétences. Votre portfolio pourrait être le facteur décisif lors de l'entretien !

✨Passion pour la biologie

Lors de votre entretien, n’hésitez pas à partager ce qui vous passionne dans le domaine de la biologie. Des projets récents, des découvertes marquantes ou même des livres qui vous ont inspiré peuvent montrer votre engagement et votre curiosité. Cela pourrait séduire l'équipe de INRAE et montrer que vous êtes prêt à vous investir.

✨Préparez-vous à des questions théoriques

Dans le domaine de la biologie, les questions théoriques sur des concepts clés sont fréquentes dans les entretiens. Révisez les bases et comprenez bien les sujets récents de recherche. La capacité à articuler des idées complexes dans un langage accessible peut également impressionner vos interlocuteurs.