Postdoctoral Researcher – Genome Editing for Genetic Skin Diseases (F/M) in Paris

Le laboratoire "Maladies génétiques de la peau : des mécanismes pathophysiologiques aux traitements", dirigé par le Prof. Alain Hovnanian à l'Institut Imagine (INSERM UMR 1163), recherche un chercheur postdoctoral très motivé pour développer des stratégies innovantes d'édition du génome pour les maladies génétiques de la peau. Le poste sera basé dans le sous-groupe d'édition génique sous la supervision du Dr. Araksya Izmiryan.

Le chercheur postdoctoral contribuera à un projet de recherche financé par l'ANR axé sur le développement d'approches thérapeutiques d'édition du génome pour l'épidermolyse bulleuse. Le projet combine l'édition de base et l'édition prime avec des cellules souches pluripotentes induites (iPSCs) dérivées de patients et des modèles d'organoïdes cutanés avancés pour enquêter et valider des stratégies de correction spécifiques aux mutations.

Le projet vise à développer et évaluer des approches précises d'édition du génome dans des modèles cellulaires et tissulaires humains cliniquement pertinents. Un accent particulier sera mis sur l'édition des cellules dérivées de patients, suivie d'une validation fonctionnelle dans des modèles cutanés 3D et des organoïdes cutanés.

Les principales responsabilités incluent :

• Concevoir, mettre en œuvre et optimiser des stratégies d'édition de base et d'édition prime ;
• Concevoir et caractériser des ARN guides, y compris l'évaluation de l'efficacité d'édition, de la spécificité et de la toxicité potentielle ;
• Développer et évaluer des stratégies de livraison, y compris des nanoparticules lipidiques (LNPs) ;
• Effectuer l'édition du génome dans des kératinocytes humains, des fibroblastes et des iPSCs RDEB dérivés de patients ;
• Cultiver et maintenir des iPSCs humaines et contribuer à leur différenciation en populations cellulaires cutanées pertinentes ;
• Développer, cultiver et caractériser des organoïdes cutanés dérivés de patients et des équivalents cutanés 3D pour la modélisation de maladies et la validation fonctionnelle ;
• Effectuer des analyses de biologie moléculaire et cellulaire, y compris l'extraction d'ADN/ARN/protéines, PCR, RT-PCR, séquençage Sanger et NGS, FACS, immunocytochimie et immunohistochimie ;
• Évaluer la correction aux niveaux moléculaire et fonctionnel, y compris l'intégrité de la jonction dermo-épidermique et l'expression du collagène VII dans des modèles d'épidermolyse bulleuse pertinents ;
• Contribuer aux analyses de séquençage d'ARN à cellule unique (scRNA-seq) et de transcriptomique spatiale pour caractériser les cellules et organoïdes cutanés édités, évaluer les états cellulaires et la différenciation, et enquêter sur les réponses moléculaires et spatiales à la correction du génome ;
• Analyser et interpréter les données expérimentales et contribuer aux présentations scientifiques, manuscrits et rapports de projet.

Une formation peut être fournie pour des techniques avancées spécifiques si nécessaire.

Profil du candidat :

• Doctorat en sciences de la vie, biologie moléculaire/cellulaire, génétique, biologie des cellules souches, biologie de la peau ou domaine connexe ;
• Expérience pratique solide en biologie moléculaire et cellulaire ;
• Une expérience avec les technologies d'édition du génome est fortement souhaitable ;
• Une expérience en biologie de la peau et/ou culture de cellules souches est un avantage ;
• Une expérience avec la culture et la manipulation d'iPSCs et/ou de modèles d'organoïdes 3D est fortement souhaitable ;
• Une expérience avec le séquençage, la cytométrie en flux et les analyses moléculaires quantitatives est un avantage ;
• Une expérience avec la transcriptomique à cellule unique, la transcriptomique spatiale et/ou l'analyse de jeux de données de séquençage à haute dimension est un avantage ;
• Des compétences en bioinformatique ou en analyse de données sont appréciées.

Compétences et qualités personnelles :

• Rigueur scientifique et engagement envers la reproductibilité ;
• Capacité à travailler de manière autonome tout en contribuant efficacement à une équipe pluridisciplinaire ;
• Solides compétences organisationnelles, de communication et de résolution de problèmes ;
• Curiosité, adaptabilité et motivation pour développer des approches thérapeutiques innovantes ;
• Bon niveau d'anglais écrit et parlé.

Environnement de recherche :

Le candidat retenu rejoindra une équipe pluridisciplinaire d'environ 15 chercheurs au sein de l'INSERM UMR 1163 à l'Institut Imagine pour les Maladies Génétiques à Paris. L'institut offre un environnement international hautement interactif et un accès à des installations de pointe en génomique, bioinformatique, imagerie avancée, cytométrie en flux et modèles précliniques. Le laboratoire a établi une expertise dans les maladies génétiques de la peau, l'édition du génome, la biologie épithéliale et des cellules souches, les organoïdes cutanés et le développement thérapeutique translationnel.

Ce que nous offrons :

• Un poste au sein d'un projet financé par l'ANR à l'interface de l'édition du génome, de la biologie des cellules souches et de la dermatologie translationnelle ;
• Accès à des technologies avancées et à des plateformes pluridisciplinaires à l'Institut Imagine ;
• La possibilité de développer une expertise en édition de base, édition prime, cellules souches épithéliales, iPSCs et organoïdes cutanés dérivés de patients ;
• Un environnement de recherche collaboratif et orienté vers l'international avec de fortes opportunités de développement scientifique.

Application :

Les candidats doivent envoyer les documents suivants :

• Curriculum vitae ;
• Lettre de motivation décrivant l'expérience de recherche et la motivation pour le poste ;
• Coordonnées d'au moins deux références académiques.